Региональные подразделения и филиалы ОАО «РЖД»
Московская дирекция инфраструктуры
Московская дирекция управления движением
Московская дирекция тяги
Московская дирекция энергообеспечения
Красноярская дирекцией инфраструктуры
Московская дирекция моторвагонного подвижного состава
Центральная дирекция связи
Дирекция аварийно-восстановительных средств
Центральная дирекция по управлению терминально-складским комплексом
Московская дирекция материально-технического обеспечения
Центральная дирекция пассажирских обустройств
Дирекции капитального ремонта и реконструкции объектов электрификации и электроснабжения железных дорог
Дочерние и зависимые компании ОАО «РЖД»
Филиалы АО «Федеральная пассажирская компания»
АО «Центральная ППК»
ОАО «Московско-Тверская пассажирская компания»
АО «Вагоноремонтная компания – 1»
АО «Вагоноремонтная компания – 2»
АО «Вагоноремонтная компания – 3»
Экспериментальное кольцо АО «ВНИИЖТ»
Другие организации и фирмы
ООО «ВагонРемСервис»
ГУП «Московский метрополитен»
ОАО «НАК «Азот»
ОАО «Росжелдорпроект»
ОАО «РЖДстрой»
ОАО «Промжелдортранс»
ЗАО ТК «Гранд Сервис Экспресс»
АО «ТрансКлассСервис»
ОАО «Тверской Экспресс»
ОАО «ВПК «НПО машиностроения»
ОАО «Трансэлектромонтаж»
ОАО «Очаково-Промжелдортранс»
ООО «МВПС-Сервис»
ОАО "ВРП "Грязи"
ОАО «Коломенский завод»
ООО «Геопроектизыскания»
ООО «ТПК «Промтехдепо»
ООО «УРАЛХИМ- ТРАНС»
АО «НАК «Азот»
ЗАО «Железногорский вагоноремонтный завод»
ООО «ТМХ-Сервис»
АО «Ковдорский ГОК»
ОАО «Люблинский ЛМЗ»
и многие другие.